Windows vista es una basura en cuanto a rendimiento pero pa poner el Fl a funcionar a la perfeccion sin errores hay que hacer par de cositas:

Windows vista tiene nuevas politicas de seguridad pa los programas escribir y leer datos, (aunque toda esa basura no evita para nada los molestos virus y troyanos) pa evitar esos errores agarras la carpeta imageline en archivos de programa y le das click derecho, luego propiedades, ahi buscas la ficha de compartir y seguridad, ahi cambias los permisos a los usuarios para que cualquier usuario logeado (sin tener que ser explicitamente el administrador) pueda hacer que sus programas accedan a los datos de la pc directamente (sin joder mucho con lo de lo dela seguridad). pa eso seleccionas todos los permisos, Escritura, lectura, ejecucion, etc. todo para el usuario Everything, y asi la carpeta Image Line y todos los programas en ella (fl.exe) se ejecutan sin problema.

Pa aumentar un poco el rendimiento prueba a desactivar la caracteristica Aero de los temas visuales nuevos (algo muy bonito pero te jode el rendimiento de tu estacion de trabajo)

Puedes hacer lo mismo para tu carpeta de VST favorita.
Espero que te sirva de ayuda.

Verdad que Vista es una porqueria, no?